La caractéristique anatomique la plus distinctive de l'iguane marin réside dans son ensemble d'adaptations qui lui permettent de se nourrir efficacement en milieu aquatique. Contrairement à tout autre lézard moderne, l'iguane marin (Amblyrhynchus cristatus) passe une grande partie de son temps immergé dans les eaux froides de l'océan, à la recherche d'algues sur les rochers submergés. Le succès de ce comportement repose sur une combinaison de modifications évolutives, notamment au niveau de la forme de la queue et de la morphologie corporelle, qui le rendent exceptionnellement adapté à la locomotion aquatique.
La queue de l'iguane marin est comprimée latéralement, formant une structure musculaire verticale dont la fonction est similaire à celle de la nageoire caudale d'un poisson. Cette forme aplatie augmente la surface dans le plan vertical, optimisant la propulsion lors des ondulations latérales. Lorsqu'ils nagent, les iguanes marins ne s'appuient pas principalement sur leurs membres pour se propulser. Ils utilisent plutôt leur queue pour créer des mouvements ondulatoires le long du corps, se propulsant avec précision et contrôle malgré les forts courants marins. Le mouvement est sinusoïdal, partant de la base de la queue et s'étendant vers son extrémité, assurant une propulsion efficace avec une dépense énergétique minimale.
Ce comportement de nage permet à l'iguane de se déplacer avec grâce dans les eaux côtières peu profondes et même dans les zones de ressac plus agitées. La forme de sa queue joue également un rôle dans son équilibre et sa direction. Lorsqu'il navigue entre les rochers immergés ou qu'il poursuit des algues en profondeur, la queue contribue à stabiliser sa posture et lui sert de gouvernail pour se diriger avec une résistance minimale. Cette particularité réduit considérablement le coût métabolique de la plongée et prolonge le temps que l'animal peut passer sous l'eau, ce qui est crucial compte tenu des températures froides de l'eau dans le milieu marin des Galápagos.
Le reste du corps a également évolué pour optimiser la vie aquatique. Le torse, légèrement aplati et hydrodynamique, minimise la résistance à l'eau. La forme générale, compacte et allongée, du corps améliore les performances de nage sans compromettre la capacité de l'animal à se déplacer sur terre. Cette morphologie à double usage est essentielle, car l'iguane marin partage son temps entre les bains de soleil terrestres et la recherche de nourriture en milieu aquatique.